自新冠大流行以來，盡管全國已經(jīng)采取多種措施遏制SARS-CoV-2傳播，但由于德爾塔、拉姆達等變異菌株糾纏不清，“曝光率”正日漸提高，使得全球疫情一次次陷入危機之中。

此前，有相關(guān)研究表明新冠病毒的變異速度為每兩周變異一次，然而近日，來自巴斯大學(xué)和愛丁堡大學(xué)的科研團隊發(fā)表于《Genome Biology and Evolution》雜志的一篇題為Causes and consequences of purifying selection on SARS-CoV-2的新研究似乎又讓人心涼了一截。

這項最新研究推翻了先前的研究成果，指出此前的研究忽略了大量已經(jīng)發(fā)生但從未被測序的突變。事實上，SARS-CoV-2幾乎每周發(fā)生一次變異，變異速度比此前認為的高50%以上，未來，新型冠狀病毒“異軍”的出現(xiàn)速度或許會比我們想象得更快。

https://doi.org/10.1093/gbe/evab196

病毒的基因組在其增殖過程中不是一成不變的，在其復(fù)制過程中遺傳物質(zhì)會出現(xiàn)復(fù)制“錯誤”現(xiàn)象，時時刻刻有突變的風(fēng)險。然而，這種“風(fēng)險”對于某些新冠病毒來說可能是好事，即“正面選擇”，它們通過變異來完善自己，讓自己進化，從而提高自己的傳染性。但也有少數(shù)新冠變異對病毒有害，發(fā)生“負面選擇”，會降低其生存率，使他們無法再人體內(nèi)存活太久，因此當(dāng)我們在進行新冠病毒測序計算病毒的突變速度時，無法及時捕捉到它們。

在這項最新的研究中，科研人員估計了不同核苷酸組成的四倍簡并位點（4DTv）的比率以評估基因組是否發(fā)生全基因組復(fù)制事件，并使用這些核苷酸依賴的比率來推斷真正的潛在突變率，從而推斷出缺失突變的比率。不僅如此，他們還利用生物信息學(xué)中最常見的Ka/Ks分析法推斷出新冠病毒可能“缺失”的突變比率，若Ka/Ks>1，則認為有正選擇效應(yīng)，若 Ka/Ks<1，則認為有負面選擇作用。

綜合研究數(shù)據(jù)顯示，假如考慮到這些“隱身突變”，病毒的真實突變率至少比之前認為的高50%。因此為了降低突變速率，找到清除負面選擇的原因十分必要，研究人員發(fā)現(xiàn)，負面選擇大多源于可預(yù)測的原因，如變異使基因變短，或者使蛋白質(zhì)（如刺突蛋白）功能不良等。

（四重簡并位點的過量變體意味著負向選擇）

此前，俄羅斯報道在一名患有淋巴瘤的女子體內(nèi)曾檢測出18種變異的新冠病毒，首次確認了新冠病毒在生物體內(nèi)長期存在會導(dǎo)致大量突變出現(xiàn)，這也警醒我們?nèi)羧梭w的免疫系統(tǒng)難以控制病毒時，必須將其隔離，因為新冠病毒在人體內(nèi)生存超過幾個星期，就有可能會進化，促成新的變異體，正如阿爾法變異毒株的誕生一樣。

但巴斯大學(xué)米爾納進化中心的勞倫斯·赫斯特教授表示：“我們也不必過分恐慌，新冠病毒在患者體內(nèi)的進化幾率并不高，因為大多數(shù)人在病毒發(fā)生變異之前就已經(jīng)將體內(nèi)病毒清除。”

未來，希望科研人員能早日找到遏制病毒傳播的有效機制，讓世界重新回到新冠病毒大流行之前的狀態(tài)，讓大家重新回歸正常的生活。