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人類首次在太空中完成CRISPR基因編輯,通過DNA修復(fù)研究,為星際旅行做準(zhǔn)備

眾所周知,環(huán)境因素會(huì)造成生物體的DNA損傷,例如紫外線。在人類和動(dòng)物中,這種DNA損傷可能會(huì)導(dǎo)致癌癥。但幸運(yùn)的是,細(xì)胞有幾種不同的策略修復(fù)受損DNA。

生活在地球上的人類,受到了地球磁場(chǎng)和大氣層的保護(hù),隔絕了絕大多數(shù)來自太空的有害輻射,然而,太空中的宇航員離開了地球的保護(hù),他們會(huì)受到更強(qiáng)的輻射,因此面臨更強(qiáng)的DNA損傷風(fēng)險(xiǎn)。

現(xiàn)在,中國和美國都宣布了載人登陸火星的計(jì)劃,這種長期的星際旅行,宇航員們會(huì)面臨長期太空輻射,身在太空微重力環(huán)境下的他們,身體會(huì)選擇怎樣的策略來修復(fù)輻射導(dǎo)致的DNA損傷呢?限于之前的技術(shù)和安全障礙,這個(gè)問題一直沒能得到研究。

2021年6月30日,MiniPCR Bio、麻省理工學(xué)院、美國宇航局,以及幾位美國中學(xué)生,在 PLOS One 期刊發(fā)表了題為:A CRISPR-based assay for the study of eukaryotic DNA repair onboard the International Space Station 的研究論文。

這項(xiàng)研究是首次在太空中完成的CRISPR基因編輯實(shí)驗(yàn),為研究太空微重力環(huán)境下DNA損傷修復(fù)奠定了基礎(chǔ),對(duì)于人類探索廣闊的太空,以及將來的星際旅行,甚至星際移民具有重要意義。

在國際空間站中,受實(shí)驗(yàn)設(shè)備等多種條件限制,難以直接觀察細(xì)胞如何修復(fù)更復(fù)雜或更廣泛的損傷。因此,研究團(tuán)隊(duì)想到了CRISPR基因編輯,使用CRISPR基因編輯造成細(xì)胞DNA的精確損傷,然后在國際空間站的宇航員就可以觀察細(xì)胞上如何將這些DNA損傷修復(fù)的。

宇航員在國際空間站上通過對(duì)酵母細(xì)胞的實(shí)驗(yàn),使用CRISPR基因編輯酵母細(xì)胞,使其DNA產(chǎn)生精確損傷、培養(yǎng)酵母使其修復(fù)DNA、提取基因組并PCR,以及對(duì)基因組進(jìn)行納米孔測(cè)序,這些全部實(shí)驗(yàn)過程均在國際空間站的太空飛行環(huán)境中進(jìn)行。

研究團(tuán)隊(duì)使用了營養(yǎng)缺陷型酵母,這種酵母由于缺乏尿嘧啶生物合成所必須的URA3基因,因此無法在不含尿嘧啶的人工合成培養(yǎng)基中生存繁殖。

然后,NASA宇航員對(duì)這些酵母進(jìn)行了轉(zhuǎn)化實(shí)驗(yàn),導(dǎo)入攜帶了URA3基因、Cas9基因和靶向ADE2基因的sgRNA,以及針對(duì)ADE2基因的修復(fù)模板。

正常情況下,酵母在培養(yǎng)基上形成的菌落為白色,而當(dāng)ADE基因突變后,菌落呈紅色。

質(zhì)粒轉(zhuǎn)化后,這些營養(yǎng)缺陷型酵母由于導(dǎo)入了URA3基因,從而可以在不含尿嘧啶的人工合成培養(yǎng)基中生存和繁殖并形成菌落,而且,觀察到了培養(yǎng)基中出現(xiàn)了紅色酵母菌落,可以直觀看出CRISPR基因編輯成功編輯了ADE2基因。PCR實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步證明了CRISPR基因編輯的成功。

此外,還通過納米孔測(cè)序,進(jìn)一步推斷這些酵母所采取的細(xì)胞修復(fù)機(jī)制,測(cè)序結(jié)果表明,所有被成功基因編輯的呈紅色的菌落,它們的基因序列與修復(fù)模板序列一致,這表明它們都是通過同源重組進(jìn)行的修復(fù),而不是非同源末端連接的修復(fù)方式。這位將來量化DNA修復(fù)途徑奠定了基礎(chǔ)。

這項(xiàng)研究成功證明了這種新方法的可行性,這項(xiàng)研究標(biāo)志著CRISPR/Cas9基因組編輯首次在太空成功進(jìn)行,這也是首次在太空中向活細(xì)胞中導(dǎo)入來自生物體外部的遺傳物質(zhì)。

研究團(tuán)隊(duì)表示,希望這項(xiàng)技術(shù)能夠?qū)μ罩械腄NA修復(fù)進(jìn)行廣泛的研究,接下來還將繼續(xù)改進(jìn)新方法,以便更好地模擬電離輻射引起的復(fù)雜DNA損傷。

值得一提的是,這項(xiàng)研究的想法,是由美國兩個(gè)高中的幾名學(xué)生提出,并在學(xué)術(shù)界、工業(yè)界和NASA的支持下得以完成。

總的來說,這項(xiàng)研究不僅在太空極端環(huán)境下成功進(jìn)行了CRISPR基因組編輯、miniPCR納米孔測(cè)序等新技術(shù),而且還能將這些新技術(shù)整合到一起,用來研究太空微重力環(huán)境下的DNA修復(fù)和其他細(xì)胞基本過程。這對(duì)于人類探索廣闊的太空,以及將來的星際旅行,甚至在星際移民具有重要意義。

論文鏈接:

https://doi.org/10.1371/journal.pone.0253403

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